• Адміністрація
• Вчена рада
• Рада молодих вчених
• Спеціалізована вчена рада, 03.00.17
• Нормативні документи
• Відділ екологічної інтеграції біоциклів
• Відділ екології крайових угруповань
• Відділ якості водного середовища
• Відділ морфофункціональної екології водної рослинності
• Бібліотека
• Науково-організаційна група інформаційного забезпечення
• Міжвідомча лабораторія екосистем Азовського басейну
• Конференції
• Історія