Основні напрями досліджень:

• Розробка методології вивчення просторово-часової організації угруповань одноклітинних і багатоклітинних гідробіонтів;
• Виявлення специфіки структури і функціонування донних угруповань гідробіонтів в різних біотопах (пісок, твердий субстрат);
• Аналіз сукцесійних змін в структурі угруповань донних гідробіонтів на твердому субстраті та піщаному ґрунті на одноклітинному і багатоклітинному рівнях;
• Вивчення взаємовідносин між одноклітинними і багатоклітинними організмами у різних біотопах, екотонах і біоциклах;
• Розробка практичних рекомендацій по обґрунтуванню системи моніторингу екотонів біоциклів як ефективного інструменту діагностики стану водних екосистем, та їх охорони;
• Дослідження структури та функціонування угруповань гідробіонтів в залежності від градієнтів змін факторів середовища;
• Дослідженняз зміни стану угруповань гідробіонтів у результаті впливу екстремальних факторів середовища та кліматичних змін;
• Оцінка фенотипічної пластичності різних видів морських гідробіонтів;
• Розробка рекомендацій щодо системи екологічного моніторингу, оптимізації господарської та природоохоронної діяльності.