Напрями діяльності:

• Вивчення закономірностей формування угруповань гідробіонтів в водоймах Азовського басейну та суміжних територій.
• Моніторингові роботи з дослідження абіотичних факторів (гідрологічний та гідрохімічний режим), гідробіологічного режиму (планктон, бентос), стану іхтіофауни (видовий склад, міжвидова та внутрівидова структура популяцій, фізіологічний та епізоотологічний стан, міграції тощо).
• Зонування водойм регіону досліджень з метою розробки рекомендацій щодо підвищення їх біологічного різноманіття та стабільного функціонування.
• Виявлення закономірностей формування біорізноманіття гідробіонтів та його взаємодії у водоймах Азовського басейну.
• Розвиток прикладних аспектів та пошук шляхів збільшення біологічного різноманіття та ємності екосистем за рахунок використання штучних субстратів (штучних рифів) та аквакультури.
• Залучення студентів до активної дослідницької роботи

Основними завданнями діяльності Лабораторії є:

• Проведення спільних комплексних іхтіологічних та гідроекологічних досліджень і моніторингу водойм Азовського басейну.
• Розробка та створення програм з охорони та раціонального використання водойм в районі досліджень.
• Виконання розділів наукових програм, розроблених спільними силами спеціалістів двох установ.
• Залучення наукового потенціалу для підвищення рівня наукової діяльності студентів.
• Підвищення загального рівня досліджень за рахунок об’єднання науково-методичного потенціалу двох установ, створення спільної бази даних і комп’ютерних програм обробки фактичного матеріалу тощо.
• Досягнення високого рівня екологічної підготовки та обізнаності студентів.
• Популяризація наукових досліджень на сторінках Всесвітньої мережі Інтернет та ЗМІ.
• Співробітництво на основі іхтіологічних та гідробіологічних досліджень з науковими українськими, іноземними та міжнародними установами, організаціями та фондами.